在时任国务院总理朱镕基同志的倡导和推动下，国务院于1998年7月批准成立国家会计学院，教学管理依托清华大学。学院后来更名为“北京国家会计学院”，现为财政部所属事业单位，董事会主席由财政部部长担任。学院现设有会计、审计、税务和金融四个硕士研究生学位项目，是国内首批开展会计专业硕士研究生教育工作的单位，为我国宏观经济管理部门、大中型企业培养了大批财务、金融领域的高端人才，同时一直作为财经智库为国家的发展建设，特别是会计与审计领域的政策标准、改革方向提供研究支持。
